复旦大学公共卫生学院昨天爆出消息,该院青年教师熊成龙、张志杰等用生物信息学为手段,研究分析H7N9禽流感病毒基因,最后寻找了该病毒的起源和进化规律。今年侵袭我国部分地区的H7N9禽流感,中外学术界专家指出病毒源于中国和韩国的禽类。但复旦大学学者首次找到,该病毒的2个最重要蛋白源于中国华东地区的家禽或野鸟。
笔者昨日从复旦大学得知,涉及论文已于近日在线公开发表在国际传染病领域知名期刊美国《临床病毒感染病》(ClinicalInfectiousDiseases)杂志。该成果对今后防治和本源流感与禽流感有最重要意义。
分析300余NA序列,找到“N9基因”源于中国据理解,复旦大学公共卫生学院青年教师熊成龙、张志杰等以先进设备的生物信息学为手段,对H7N9禽流感病毒基因展开研究和分析,再一寻找了该病毒的起源和进化规律,即首次找到该病毒的2个最重要蛋白HA和NA并非如此前中外学术界专家所指出的“分别源于中国和韩国禽类”,而是源于中国华东地区的家禽或野鸟。2月19日起,我国华东地区相继经常出现系列流感样病例,3月31日,中华人民共和国公共卫生与计划生育委员会通报证实病毒感染病原为新型H7N9亚型禽流感病毒。
对于该病毒的起源,中外学术界专家普遍认为来自中韩禽类,他们指出根据收集到的1株H7亚型HA(即H7N3病毒)源于中国杭州的杭州鸭,而收集到的7株N9亚型NA(即H7N9病毒)则源于韩国禽类。熊成龙、张志杰研究团队尊重中外学术界专家对HA来源的报导,但对NA来源则有异议。核苷酸是包含基因的最基本单位,氨基酸是包含蛋白的最基本单位,对核苷酸和氨基酸的同源展开分析,就需要搞清楚病毒的起源和进化规律。
为此,熊成龙、张志杰研究团队分析了全球分享的流感数据库中(还包括本次病原代表株H7N9病毒以及2006—2011年的7株韩国株NA亚型株在内)长度小于1000核苷酸的N9基因序列共321个NA序列,并由此推论出有适当的蛋白质氨基酸序列,最后证实,H7N9禽流感病毒的最重要蛋白HA(N9基因)源于中国江苏洪泽湖花脸鸭(即H11N9病毒株),即NA蛋白并非源于韩国。不利于精确推测流感病毒起源与进化规律熊成龙、张志杰研究团队指出最重要的依据是,从基因的核苷酸和蛋白质氨基酸序列相似性搜寻结果来看,H7N9病毒的最重要蛋白NA与H11N9病毒在核苷酸和氨基酸层次上序列的相似性分别是96.2%和96.8%;而与7株韩国株NA亚型株相似性分别是93.3%至95.5%和87.9%至96.4%。前者远高于后者。
熊成龙、张志杰研究团队研究还指出,杭州是H7N3病毒的分离出来地,也是本次流感风行的主要疫区之一,洪泽湖是中国第4大淡水湖,是水禽的主要栖息地之一,也是H11N9病毒的分离出来地,也就是说,从本次流感最初发生地、H7亚型HA贡献株分离出来地,以及H11N9病毒分离出来地点来看,皆坐落于中国的华东地区,从地理位置上来看,病毒株再次发生重组的可能性也远高于韩国株。据报,这一找到将为精确推测流感病毒的起源与进化规律获取适当的理论依据,同时为更进一步研究流感病毒的传播与风行规律,早期预警流感传播,进而采行大力有效地的防治控制策略等有最重要指导意义。
■链接食品药品监管总局:临床用人病毒感染H7N9检测试剂获批上市根据国家食品药品监督管理总局22日发布的消息,上海之江生物科技股份有限公司申报的“人病毒感染H7N9禽流感病毒RNA检测试剂盒(荧光PCR法)”和中山大学达安基因股份有限公司申报的“H7N9禽流感病毒RNA检测试剂盒(荧光PCR法)”皆于21日取得国家食品药品监督管理总局批准后,标志着我国临床用人病毒感染H7N9禽流感病毒诊断试剂首度批准后上市。这两种诊断试剂皆基于荧光PCR方法,可对具备流感样症状的患者或者涉及密切接触者的鼻咽拭子、口咽拭子、痰液等呼吸道分泌物样本中的H7N9禽流感病毒RNA展开体外定性检测,检测结果可用作临床辅助临床患者否病毒感染H7N9禽流感病毒。
根据国家公共卫生和计划生育委员会发布的统计数字,截至5月20日16时,我国内地共计报告130例人病毒感染H7N9禽流感发病病例,其中丧生36人,康复72人。H7N9禽流感魔爪频伸展中青年非因病毒变异到年底了,加班费的人一挺多,有些“连轴转”的上班族,疲惫之后,更容易发烧,也更容易让H7N9禽流感病毒有可乘之机。专家建议,如果有倒数感冒,应去医院验血检查,白细胞指标如果不低,肺部有炎症,并且有过禽类认识经历,最差再测一下H7N9病毒核酸。
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